色谱填料又称为层析介质，分为亲水型色谱填料和疏水型色谱填料两种。
亲水色谱填料：主要适用于非极性至中等极性的中小分子化合物的分离，硅胶表面的硅羟基或其它极性基团极性较强。主要应用于药物合成化学、天然产物、精细化工、石油产品等领域的分离和提纯。
疏水色谱填料：在传统固定相长链根部嵌入特殊基团，该“极性嵌入基团”能够和硅胶表面的硅羟基或流动相中的水形成氢键，对硅胶基质形成一种保护作用，且减少碱性化合物与硅羟基的作用，保证了碱性化合物的良好分离，对具有复杂结构的碱性化合物表现出不同于传统反相色谱的分离性能，即不需要“使用 pH>7 的流动相来抑制碱性物质的解离”的方式就可以对碱性物质实现良好的色谱保留；对复杂的样品分离，如混合物中同时具有极性、中性和非极性的化合物时，可以实现一次分离，而且抗污染能力出色；键合相流失率极低，保留性能稳定。
